很多药物的作用，疗效、毒性、不良反应与人体的生物钟有着密切的联系。同等剂量的药物给药的时间不同，作用、疗效和不良反应也不一样。
1、清晨服用
糖皮质激素：泼尼松、地塞米松等，因为人体激素的分泌高峰出现在早晨7~8点，此时服用可以避免药物对激素分泌的反射性抑制作用，可减少不良反应。
抗寄生虫药：甲苯咪唑、阿苯达唑等早晨空腹使用，减少了人体对药物的吸收，增加药物与虫体的接触，增强了疗效。
2、餐前服用
抗酸药：磷酸铝凝胶等，餐前服用可充分附着于胃壁，对胃壁形成保护。
促胃肠动力药：甲氧氯普胺（胃复安）、多潘立酮、莫沙必利等餐前服用，促进肠胃蠕动和食物排空，帮助消化。
抗生素：头孢克洛、头孢地尼、阿奇霉素、克拉霉素、阿莫西林等饭前服用，以利于吸收和获得最佳的疗效。宜于餐前1小时服用。
3、餐中或与食物同服
抗糖尿病药：二甲双胍、阿卡波糖等宜餐中服用，减少对胃肠道的刺激和降低其导致腹胀的不良反应。
抗病毒药：更昔洛韦、阿昔洛韦应进餐时服用，以利于吸收。
4、两餐中间服用
铁剂：琥珀酸亚铁等，餐中或者两餐间服用，减少对胃的伤害，亦不影响铁的吸收。
胃黏膜保护药：蒙脱石等，餐后或两餐间服用，其作用是覆盖消化道，增强黏液屏障。
5、餐后服用
非甾体类抗炎药：布洛芬、对乙酰氨基酚、阿司匹林等，餐后服用减少对胃肠的刺激。
维生素：维生素B2餐后服用利于吸收。
抗菌药物：头孢呋辛酯等，餐后服用提高血药浓度，减少不良反应。
6、睡前服用
平喘药：沙丁胺醇、氨茶碱等，哮喘多发作于凌晨，睡前服用，止喘效果更好。
抗过敏药：氯苯那敏、酮替芬、赛庚啶等，服用后易出现瞌睡、注意力不集中等副作用，睡前服用安全且有助睡眠。
缓泻药：酚酞等服用后12小时排便，睡前服用刚好次日晨起时泻下。
钙剂：如果是分两次服用钙剂，应在餐后或进餐是服用，此时胃酸大量分泌有利于钙剂的溶解，同时中和钙剂的强碱性，减少钙剂对胃的刺激性。
含钙量较大的制剂睡前补充最好，此时血钙水平比白日较低，低血钙水平可使骨骼中钙的提取和分解速度加快，另外由于人的体液调节会将多余的钙从尿液排除，尿液钙在夜间形成时，因为没有食物补充，只能由骨骼中的钙形成，为了避免其动用人体自身的钙库，夜间补钙刚好满足了它的需求，减少骨质疏松的发生，让骨骼对钙剂得到更好的吸收和利用。
